Die klassische Anwendung der marinen Magnetik ist das dicht unter der Wasseroberfläche an einem Messkabel hinter dem Schiff geschleppte Magnetometer. Der Abstand zum Schiff muss mehrere hundert Meter betragen, um das magnetische Eigenfeld des Schiffs zu vermeiden. In der modernen Auslegung werden mehrere Magnetometersonden kombiniert, um auch den Gradienten des Erdmagnetfeldes und seine Komponenten in drei Raumrichtungen messen zu können (Vektormagnetometer).