Die BÜK3000 wurde ursprünglich als populärwissenschaftliche Bodenübersichtskarte für den Nationalatlas der Bundesrepublik Deutschland aus der BÜK2000 abgeleitet.
Nach der inhaltlichen und räumlichen Aktualisierung dieser Kartengrundlage, die mit der Erarbeitung der BÜK2000N erfolgte, wurde auch die BÜK3000 zu einer Version 2.0 nachgeführt. Die Kartenlegende dieser Version umfasst auch weiterhin 43 bodenkundliche Legendeneinheiten mit Angaben zu Bodenarten, Ausgangsgestein sowie Leit- und Begleitböden.
Die Version 2.0 basiert auf den topographischen Grundlagen des Digitalen Landschaftsmodells 1:1.000.000 (DLM1000) des Bundesamtes für Kartographie und Geodäsie.